师资名录

邹一可

长聘教轨副教授

 

邮箱:zouyike@sjtu.edu.cn
主页:https://www.x-mol.com/groups/zouyike/people/70264

8188www威尼斯长聘教轨副教授/博士生导师/课题组长
学科方向:人工智能与计算机科学在新药研发中的应用

研究领域:
• 计算机辅助药物设计
• 计算机辅助酶工程学改造
• 药物化学
理论计算建模 + 实验

学习经历
2012-2017:美国宾夕法尼亚大学,有机化学,博士学位 (导师:Amos B. Smith, III)
研究方向:复杂天然产物全合成
2007-2010:成都中医药大学,中药化学,硕士学位 (导师:郭力)
研究方向:中药石斛有效成分研究
2003-2007:成都中医药大学,中药学,学士学位
研究方向:中药复方“四君子汤”配伍物质基础

工作经历
2024-至今:8188www威尼斯 / 张江高等研究院,长聘教轨副教授
研究方向:人工智能与计算机科学在新药研发中的应用
2022-2023:美国劳伦斯利弗莫尔国家实验室,研究员
研究方向:计算机辅助生物医药企业新药研发
2018-2022:美国加州大学洛杉矶分校,博士后(导师:Ken Houk)
研究方向:从头设计全新酶;计算化学研究酶、小分子、过渡金属催化反应机理
2010-2012:美国密西西比大学,访问研究员(导师:Mark Hamann)
研究方向:新型海洋天然产物的提取、分离、鉴定

主要成果/奖励
发表论文:52篇,其中包括以第一作者或通讯作者身份在Nature子刊和JACS上发表10余篇。
个人荣誉:入选国家海外高层次人才引进计划青年项目(2021年),国家优秀自费留学生奖学金(2016年)。
1.将人工智能以及计算机技术应用于新药研发:
• 利用人工智能算法快速生成全新药物候选分子。
• 利用人工智能和计算机技术指导创新药物研发的全过程。

2. 将人工智能以及计算机技术应用于酶工程学改造:
• 改造和优化酶的结构与功能。
• 提高酶的稳定性、活性和特异性,为生物制药开拓新前景。

课题组聚焦于运用先进计算机技术设计以及开发具有特定功能的大分子以及小分子,是新药研发和生物技术领域的前沿应用型研究。通过交叉整合计算机、化学、生物学三个领域的技术手段,加速创新大分子以及小分子的研发,在推动学科边界的同时为相关行业带来应用价值。欢迎计算机专业人员,人工智能建模及应用、计算化学、分子动力学、有机合成、药物化学方面的博士、博士后、助理研究员、科研助理加入。我们将全力协助你事业的发展!
代表性论文:
1. “A pyridoxal 5’-phosphate-dependent Mannich Cyclase.” Nature Catalysis 2023, 1-11. doi.org/10.1038/s41929-023-00963-y
2. “A 2+2/4+2 Cyclase.” Nature Chemistry 2023, 1-8. doi.org/10.1038/s41557-022-00918-z
3. “Enzymatic control of endo- and exo-stereoselective Diels–Alder reactions with broad substrate scope.” Nature Catalysis 2021, 4 (12), 1059-1069. doi.org/10.1038/s41929-021-00717-8
4. “Mechanisms and Dynamics of Synthetic and Biosynthetic Formation of Delitschiapyrones: Solvent Control of Ambimodal Periselectivity.” J. Am. Chem. Soc. 2021, 143 (30), 11734-11740. doi.org/10.1021/jacs.1c05293
5. “Nonenzymatic Stereoselective S-Glycosy¬lation of Polypeptides and Proteins” J. Am. Chem. Soc. 2021, 143 (31), 11919-11926. doi.org/10.1021/jacs.1c05156
6. “Efficient Lewis acid catalysis of an abiological reaction in a de novo protein scaffold.” Nature Chemistry 2021, 13, 231-235. doi.org/10.1038/s41557-020-00628-4
7. “Computational Investigation of the Mechanism of Diels–Alderase PyrI4” J. Am. Chem. Soc. 2020, 142, 20232-20239. doi.org/10.1021/jacs.0c10813
8. “Computational exploration of a redox-neutral organocatalytic Mitsunobu reaction” J. Am. Chem. Soc. 2020, 142, 38, 16403–16408. doi.org/10.1021/jacs.0c07487
9. “Origins of selective formation of 5-vinyl-2-methylene furans from oxyallyl/diene (3+2) cycloadditions with Pd(0) catalysis” J. Am. Chem. Soc. 2019, 141, 12382-12387. doi.org/10.1021/jacs.9b05762
10. “Computationally-assisted discovery and assignment of a highly strained and PANC-1 selective alkaloid from Alaska’s deep ocean” J. Am. Chem. Soc. 2019, 141, 4338-4344. doi.org/10.1021/jacs.8b11403
11. “Total synthesis of (−)-nodulisporic acids D, C, and B: evolution of a unified synthetic strategy” J. Am. Chem. Soc. 2018, 140, 9502. doi.org/10.1021/jacs.8b04053
12. “Total synthesis of architecturally complex indole terpenoids: strategic and tactical evolution” J Antibiot 2017, 30, 94. doi.org/10.1038/ja.2017.94
13. “Total synthesis of (−)-nodulisporic acid D” J. Am. Chem. Soc. 2015, 137, 7095.
doi.org/10.1021/jacs.5b04728
所有已发表论文列表: https://scholar.google.com/citations?user=O5GrfCMAAAAJ&hl=en-US
• 计算机辅助新药研发领域:协助生物医药企业推动多个首创药物的先导化合物进入动物实验阶段。
• 酶设计领域:运用计算机辅助技术从头设计了具有催化活性的全新酶,被C&EN News重点报道。
• 酶催化、小分子催化、过渡金属催化领域:计算机辅助解析催化反应机理,以第一作者或通讯作者在Nature子刊、JACS等发表论文7篇。
• 天然产物全合成领域:完成3个复杂天然产物的首次全合成,以第一作者在JACS发表论文2篇。
• 天然产物发现领域:从深海生物中提取、分离、并鉴定了一种对胰腺癌肿瘤细胞具有选择性抑制作用的新型分子,以第一作者在JACS发表论文1篇。

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